통도사 약사전은 관음전 아래쪽에 위치한 건물로 정면 3칸, 측면 1칸의 건물인데, 측면 칸이 상당히 넓게 건립되었다. 공포는 다포양식으로 결구되었으며, 지붕은 맞배지붕이다. 지붕에 올려진 기와의 명문에 의하면 조선후기인 1714년에 중수되었음을 알 수 있다. 약사전 내부의 도리와 천정의 우물반자 등에 육자진언을 비롯한 진언 다라니가 새겨져 있다.